主要荣誉:
1996年亚洲杯男单冠军;96年亚洲锦标赛混双冠军;98年亚洲锦标赛男双冠军、男团冠军;98年马来西亚公开赛男单冠军;99年第45届世乒赛混双冠军、男单亚军;99年世界乒乓球俱乐部锦标赛男团冠军;99年国际乒联巡回赛总决赛男双冠军;99年澳大利亚公开赛男单冠军;2000年瑞典公开赛男双冠军;00年波兰公开赛男双冠军;00年第45届世乒赛男团亚军;00年世界杯男单冠军;01年第46届世乒赛男团冠军、男单第3名、男双、混双八强;01年第九届全运会男单、男双冠军;01年丹麦公开赛男单冠军、男双亚军;01年日本公开赛男单四强、男双冠军;01年中国公开赛男单、男双亚军。
第45届世乒赛中马琳在决赛中击败瓦尔德内尔,一举成名。1996年就夺得了亚洲杯乒乓球赛的男单冠军,当时的马琳仅有16岁,这简直是乒乓球史上的奇迹。马琳成名要早于刘国正、王励勤等人,心理素质非常出色,善于在逆境中挽回败局。
悉尼奥运会后,改用“大球”但马琳的适应力极强,在首届采“大球”的世界杯男子单打比赛中夺得其职业生涯中第一个世界单打冠军。2001年第46届世乒赛上,马琳代表中国团体出战,并在决赛中担当重任,助中国队夺取男团冠军。
九运会上,乒乓球赛场上的马琳更是无人能敌,他是惟一一位在男团、男双、男单等3项比赛中一场未输的选手,最终顺利夺取全运会男单、男双冠军。